Кроссинговер может возникать при следующих условиях:
- большое расстояние между генами в хромосомах (чем ближе гены друг к другу, тем меньше вероятность кроссинговера);
- одна из структур Холлидея разрезана по пересекающимся нитям, а другая – нет;
- воздействие разных видов излучения;
- температурный режим;
- физиологическое состояние организма (возраст, пол и др.);
- мутации;
- некоторые хромосомные перестройки.
Необходимо добавить, что кроссинговер происходит в профазе I мейоза.