Почвы пустынь имеют очень мало перегноя, так как растительный покров разрежённый. Но есть минеральные соли, необходимые растениям. В разных пустынных районах формируются разные почвы. Чаще всего встречаются:
- песчаные пустынные;
- серозёмы и желтозёмы;
- серо-бурые песчаные;
- палево-серые.
Встречаются в пустыне такыры (растрескавшиеся засолённые почвы) и солончаки.