Органический мир Японского моря имеет свои особенности. Северная часть моря холоднее, чем южная. Поэтому в северной и северо-западной части моря растительный и животный мир соответствует умеренным широтам.
К югу от Владивостока водные массы более тёплые, обитают теплолюбивая флора и фауна.
У дальневосточного побережья фауна разных частей моря смешивается. Обитают кальмары и осьминоги. Это представители теплолюбивой фауны. Актинии, ламинария – представители более северных широт.
Обитают морские звёзды и ежи, креветки, крабы, асцидии, гребешки. Встречаются кета, минтай, камбала и другие виды рыб.