В устойчивых сочетаниях “как бы там (то) ни было” или “где бы то ни было” нужно писать частицу “ни”. Она пишется с глаголом раздельно.
Как бы там ни было, Клим оставался нашим начальником.
Если глагол “было” отрицается, то нужно писать “не” – не было. Частица “не” пишется с глаголом раздельно.
В комнате не было никого.