В конструкциях типа “прошу прощения, что так поздно” нужно ставить запятую перед “что”. Пунктуация объясняется тем, что запятая в данном случае разделяет две части сложного предложения:
- главное предложение “прошу прощения”;
- и придаточное изъяснительное “что так поздно”.
Важно запомнить, что во всех случаях перед союзом “что”, который разделяет части сложноподчиненного, будет ставиться запятая. В главном предложении фактически пропущено дополнение “за то” (“Прошу прощения (за то), что…”).
Примеры:
Извините, что поздно отправляю проект, просто пришлось вносить много правок.
Хочу предупредить, что следующая консультация состоится через неделю.