Площадь бассейна реки Енисей равна 2580 тыс. км². В России он занимает второе место по площади бассейна (после реки Обь, площадь бассейна которой равна 2990 тыс. км²). В мире Енисей находится на 7 месте по площади водосборного бассейна. Перед ним стоят такие реки, как:
- Амазонка.
- Конго.
- Нил.
- Миссисипи.
- Парана.
- Обь.
Бассейн Енисея ассиметричен. Левая часть водосборного бассейна в 5,6 раз меньше правой.
Река Енисей является границей между Восточной и Западной Сибирью.
Водосборный бассейн Енисея соседствует с бассейнами рек Обь, Таз, Пур с запада, и с бассейном реки Лена с Востока.